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实时荧光定量PCR广泛地应用于分子生物学研究的各个领域：DNA 或RNA 的绝对定量分析，基因表达差异分析，基因分型，SNP分析等。

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一般PCR仅应用一对引物，通过PCR扩增产生一个核酸片段，主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR)，又称多重引物PCR或复合PCR，它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物，同时扩增出多个核酸片段的PCR反应，其反应原理，反应试剂和操作过程与一般PCR相同

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