蛋白质的一级序列是由氨基酸按照特定顺序通过肽键连接而成的线性结构，在这条多肽链的两端，分别存在N端（氨基末端，N-terminal）和C端（羧基末端，C-terminal）。正确识别N端和C端对于蛋白质鉴定、功能解析、翻译后修饰（PTMs）研究以及生物制药质量控制至关重要。在实验研究和生物信息学分析中，通常通过化学特性、实验测序方法以及数据库搜索等策略来识别蛋白质序列的N端和C端。

一、通过化学结构识别N端和C端

在所有蛋白质分子中，N端和C端具有不同的化学特性，这使得它们在一级序列中可被明确区分：

1、N-端（N-terminal）

是蛋白质序列的起始点，其最前端的氨基酸具有一个游离的α-氨基（-NH₂），除非经过修饰（如乙酰化）。

2、C-端（C-terminal）

是蛋白质序列的终止端，其最后一个氨基酸的羧基（-COOH）通常游离，或可能被修饰（如酰胺化）。

二、通过实验方法识别N端和C端

实验上，可以利用多种方法来测定和确认蛋白质的N-端和C-端。

（1）Edman降解（Edman Degradation）：该方法通过异硫氰酸苯酯（PITC）选择性地标记N-端氨基酸，并通过化学降解逐步切割N-端残基，逐步解析其序列。Edman降解可直接确认N-端的氨基酸序列，但对乙酰化、甲酰化等修饰的N-端无效。

（2）质谱分析（LC-MS/MS）：高分辨率质谱结合特定蛋白酶（如Lys-N）酶解，可检测到N-端肽段，从而推断N-端序列及其修饰状态。

（3）化学标记：Dansyl chloride 或 Dabsyl chloride 可用于N-端特异性标记，随后进行光谱检测。

（1）羧肽酶降解（Carboxypeptidase Digestion）：使用特定的羧肽酶逐步水解C-端的氨基酸，并通过色谱或质谱检测释放的残基，以推测C-端序列。

（2）质谱分析（LC-MS/MS）：利用特定C-端蛋白酶（如Asp-N、Glu-C）进行定向酶切，然后通过LC-MS/MS鉴定C-端肽段，进一步确认C-端的氨基酸序列。

（3）化学标记：利用C-端羧基特异性标记试剂（如Click Chemistry），结合质谱或荧光检测，实现C-端的精准识别。

三、通过数据库和生物信息学方法识别N端和C端

在蛋白质组学研究中，生物信息学工具和数据库比对可以帮助识别N-端和C-端：

1、数据库比对（Database Search）

已知蛋白的一级序列存储于蛋白质数据库（如UniProt、PDB、NCBI），可以直接比对推测N-端和C-端的氨基酸序列。

2、翻译起始位点预测

通过基因序列翻译软件（如ExPASy Translate）分析mRNA序列，可以推测蛋白质的起始氨基酸（通常是甲硫氨酸，Met）。

3、C-端信号预测

某些蛋白的C-端具有特征性信号序列，如泛素化位点、跨膜锚定序列等，可通过生物信息学工具（如SignalP、NetPhos）预测C-端功能和修饰。

蛋白质的N-端和C-端可以通过其化学特性直接识别，N-端具有游离氨基（-NH₂），而C-端具有游离羧基（-COOH）。实验上，Edman降解和质谱分析是识别N-端的主要方法，而C-端则常通过羧肽酶降解或质谱技术解析。此外，化学标记和生物信息学工具也可用于辅助识别。在蛋白质组学研究中，高分辨率质谱结合数据库搜索已成为最常见的N-端和C-端测序方法。未来，随着新型化学修饰策略和人工智能数据分析的发展，N-端和C-端的识别将更加精准和高效，为蛋白质功能解析、疾病研究和生物制药提供更加可靠的工具。百泰派克生物科技为广大客户提供蛋白质N/C端测序服务。我们的“一站式”服务能为您节省时间和精力，帮助您更高效地开展相关研究。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

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