随着蛋白质组学的发展,C末端序列分析变得越来越重要。C末端决定了许多蛋白的功能、稳定性、亚细胞定位及相互作用,且往往受到翻译后修饰(PTMs)或特异性剪切的调控。然而,与N端序列测定相比,C末端测序面临更大的技术挑战,因为目前没有类似Edman降解的化学降解方法用于C端逐步测序。随着质谱技术的快速发
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在精准医学、生物制药、基础研究不断深化的当下,获取高质量的蛋白质序列信息已成为生命科学研究不可或缺的一环。蛋白质作为生物体功能执行的直接承担者,其一级结构(氨基酸序列)是理解蛋白功能、研究疾病机制、开发靶向药物的基础。随着质谱技术的飞跃式发展,基于质谱的蛋白质测序(Mass Spectrometry
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蛋白质测序是研究蛋白质结构与功能的核心技术,广泛应用于靶点发现、机制解析、生物标志物筛选、抗体表征等生物医学研究和药物开发领域。然而,随着质谱技术和化学测序手段的不断发展,市面上可选的蛋白质测序技术越来越多,不同技术的适用场景、分辨率、成本和通量也有所差异。那么,面对众多测序方案,科研人员应如何科学
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引言:为什么蛋白质序列比对如此重要? 蛋白质的功能往往蕴含在其序列信息中。氨基酸序列中的保守区域、活性位点或修饰位点,都是功能预测的关键线索。通过与数据库中已知蛋白序列进行比对,我们可以:注释未知蛋白功能;发现同源蛋白或进化分支;识别结构域、结合位点或抗原表位;为蛋白结构预测、分子对接和药物筛选打基
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在蛋白质组学与抗体研究中,De Novo测序技术以其不依赖数据库、可还原完整蛋白序列的独特优势,成为科研人员和生物医药企业的重要工具。尤其在抗体序列解析、古蛋白重建、新型抗原发现等场景下,De Novo几乎是唯一可行的解决方案。然而,由于该技术涉及复杂的质谱数据解读与算法重建,许多科研人员在项目初期
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De Novo测序,即从头推断肽段氨基酸序列,是蛋白质组学中识别未知蛋白、修饰肽段、抗体片段等的重要工具。相较于数据库搜索方法,De Novo测序不依赖参考数据库,适用于非模式物种、数据库不全、翻译后修饰、多变异样本等复杂场景。然而,传统的De Novo算法(如PEAKS、Novor、PepNovo
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在蛋白质组学研究中,基于数据库的质谱数据分析(Database Search)已成为主流。然而,随着科研深入非模式物种、天然产物、抗体工程、新肽药物等前沿领域,数据库本身的缺失或不完整,限制了传统方法的有效性。这时,一种不依赖数据库、直接从质谱数据中还原肽段氨基酸序列的方法—&mdash
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在蛋白质功能注释、结构预测和进化分析等多个生物学研究领域中,蛋白质序列比对与同源性分析已成为信息获取与假设生成的关键步骤。通过对氨基酸序列的比较,可以快速推测未知蛋白的功能、识别保守结构域、追踪蛋白家族的演化轨迹。背后的核心逻辑是基于“结构和功能的保守性往往体现在序列的保守性上&rdqu
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质谱(Mass Spectrometry, MS)作为高灵敏度、高特异性的分析技术,在生命科学尤其是药物发现领域中发挥着不可替代的作用。特别是结合蛋白质组学的定量分析,质谱为新药靶点筛选、机制研究、药物作用评价提供了强有力的支持。 一、质谱蛋白质定量分析概述 1、什么是质谱蛋白质定量分析 质谱蛋白
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蛋白质是生命活动的直接执行者,研究其表达谱的动态变化对揭示生物过程、疾病机制和药物作用路径具有关键意义。随着质谱技术的不断进步,蛋白质组学从“识别为主”的初级阶段,逐步迈入“定量为核心”的高精度时代。在此背景下,SWATH-MS(Sequential
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